引起急性气管支气管炎的病原体，常见为病毒，也可为细菌或支原体、衣原体。由病毒引起的急性气管支气管炎，是不需要应用抗生素的，有明确细菌感染证据时才应用抗生素治疗，可首选新大环内酯类或青霉素类药物，亦可选用头孢菌素类或喹诺酮类药物。
引起肺炎的病原体也是多种多样的，在治疗中包括经验治疗和抗病原体治疗，初始的时候选择的治疗基本都是经验性治疗，在经验性治疗时，青壮年和无基础疾病的社区获得性肺炎病人常用青霉素类、第一代头孢菌素等。由于我国肺炎链球菌对大环内脂类耐药率高，对该菌所致的肺炎不单独使用大环内脂类药物，对耐药肺炎链球菌可使用呼吸喹诺酮类的药物，如莫西沙星、吉米沙星、左氧氟沙星。
老年人有基础疾病或住院的社区获得性肺炎常用呼吸喹诺酮类药物、第二、三代头孢菌素、β-内酰胺类、β-内酰胺酶抑制剂或厄他培南，可联合大环内脂类的药物。医院获得性肺炎常用第二、三代头孢菌素、β-内酰胺类、β-内酰胺酶抑制剂、氟喹诺酮类或碳青霉烯类药物。
