氨甲蝶呤的副作用一般有黏膜损伤、口腔炎、舌炎、食欲减退和恶心等。
氨甲蝶呤是一种化疗药物，在血液系统疾病中，主要用来治疗急性淋巴细胞白血病和某些淋巴瘤。主要副作用是黏膜损伤和骨髓受抑制，常见副作用是口腔黏膜溃疡、口腔炎、舌炎、食欲减退以及恶心呕吐和腹泻等，严重者会引起胃肠道溃疡和出血。
另外会引起皮肤损伤，包括皮肤溃疡、皮炎等，同时也会导致骨髓造血功能受抑制，患者可能出现白细胞减少、中性粒细胞减少、血小板减少等，少数患者还会出现肝功能、肾功能异常。
所以在应用大剂量氨甲蝶呤时，应注意应用亚叶酸钙解救，同时监测氨甲蝶呤副作用。
急性淋巴细胞白血病应分类，比如是在2-7岁的小孩发生急性淋巴细胞白血病，通过分类、通过检查，可以分出低危和中高危来，对于低风险型，可通过化疗治愈。
不同于急性髓系白血病，单纯化疗可治愈。对于部分中高危急性淋巴细胞白血病，或复发难治性急性淋巴细胞白血病，经化疗骨髓缓解后可进行造血干细胞移植，成人急性淋巴细胞白血病的预后相对较差。这类患者最好接受造血干细胞移植，造血干细胞移植前，可通过化疗缓解疾病。
对于成年人来说，化疗的疗程相对较长，当然一些不符合造血干细胞移植条件的患者也可以通过化疗进行治疗。现在有一些靶向药物和一些新的免疫疗法，如car-t，也是一种免疫疗法，可以延长患者的生存时间，该疗法是一种预后良好的生物疗法。
